1、新时期农业发展的国家政策支持体系研究,周应恒(主持)、周应恒、宋洪远、程国强、黄延信、耿献辉、王学军、田旭(子项目负责人)等,国家自然科学基金重点项目,2014/01-2018/12;
2、加快构建新型农业经营体系研究,周应恒(主持)、杜志雄、耿献辉、胡浩、潘显政、严斌剑、应瑞瑶,国家社科基金重大项目,2014-2017;
3、国家现代农业(梨)产业技术体系产业经济研究,周应恒(主持)、王艳 李太平 葛继红 耿献辉 王太祥,国家农业部,2008-2015;
4、农产品价格波动与调控机制研究,周应恒(主持)、耿献辉、张晓敏、姚升等,国家自然科学基金,2012-2015;
5、建设以低碳排放为特征的农业产业体系及农产品消费模式研究,胡浩(主持)、周应恒 应瑞瑶 张广胜 安玉发 苗齐 ,国家社科基金重大项目,2010/12-2013/12;
6、农业产业安全风险管理研究,周应恒(主持)、周力、纪月清等,自主创新重点研究项目,2010/07-2013/07;
7、江苏省食品安全风险与公共政策研究,周应恒(主持)、王二朋、陶善信等,江苏省高校哲社重大项目,2011-2013;
8、国际农业产业研究:水果产业监测研究,周应恒(主持)、胡越等,农业部国际合作司,2012/01-2012/12;
9、江苏省农业现代化发展融资规划及国开行江苏行基层金融业务专项规划课题,周应恒(主持)、苗齐、严斌剑等,国家开发银行江苏省分行,2011-2012;
10、我国食品质量安全监管策略研究,周应恒(主持)、王二朋、陶善信等,国家自科基金应急项目,2011-2012;
11、基于牧户行为的草地管理模式研究——以西藏自治区为例,李祥妹(主持)、周应恒,刘爱军,王艳,葛继红,耿献辉,国家自然科学基金,2009/01-2011/12;
12、《发展经济学与中国农村发展》,周应恒(主持)、苗齐等,全国农业推广硕士专业学位研究生教材建设项目,2010/04-2010/12;
13、农产品国际贸易,朱晶(主持)、周应恒 应瑞瑶 苗齐 耿献辉 曹历娟 周力,江苏省高校“青蓝工程”科技创新团队,2010/12—2013/12;
14、农产品价格调控政策评估与完善,周应恒(主持)、刘俊杰等,国家发改委价格司,2010/04-2010/06;
15、中国蔬菜产地间竞争与主产地形成的实证研究,周应恒(主持)、李祥妹 耿献辉 卢凌霄 李洁 赵文 徐锐钊 程培罡 齐博,国家自然科学基金,2008-2010;
16、现代农业发展战略研究,周应恒(主持)、钟甫宁 王凯, 周曙东,朱晶,应瑞瑶,曾寅初,安玉发,胡浩,国家教育部人文社科研究重大课题招标项目,2007-2010;
17、南京市与同类城市“三农”发展的比较研究和对策建议,周应恒(主持)、刘俊杰、周德等,南京市农委,2009/04-2009/12;
18、2009-2012年世界主要农产品供求形势预测及对我国农业的影响,周应恒(主持)、周德等,农业部国际合作司,2009/09-2009/12;
19、特种淡水养殖品的市场流通渠道及产业发展研究,周应恒(主持)、耿献辉 卢凌霄 吕超 ,中国渔业发展战略研究中心开放基金,2006-2008;
20、科技支持社会主义新农村建设典型案例调查,周应恒(主持)、王树进 朱世桂 李祥妹 耿献辉 赵文 李洁 徐锐钊 张蕾,江苏省科技厅,2007-2008;
21、国内外现代农业发展经验及江苏现代农业竞争力研究,周应恒(主持)、杨天水 胡浩 耿献辉 赵文,江苏省政府委托,江苏省科技协会,2007-2008;
22、黄箱措施对农产品贸易影响程度分析,周应恒(主持)、周曙东 朱晶 钟甫宁 赵文 耿献辉 胡冰川 宋海英,商务部 加拿大 ,2006/03-2007/03;
23、从消费者收益角度对中国食品质量安全政策绩效进行的实证及量化分析 ,周应恒(主持)、应瑞瑶 何军,国家自然科学基金,2004/01-2006/12;
24、江苏社会主义新农村建设与指标体系研究,曲福田 周应恒(主持)、应瑞瑶 宣亚南 何军等,江苏省委宣传部、江苏省哲学社科重点项目,2006/01-2006/08;
25、农业应急管理能力建设研究,周应恒(主持)、耿献辉等,农业部软科学,2006/06-2006/06;
26、城市污水处理厂污泥处置技术政策研究,周立祥(主持)、周应恒,江苏省建设厅科技招标项目,2004/10-2006/05;
27、江苏现代农业产业发展研究,周应恒(主持)、宣亚南 应瑞瑶 王树进 许朗,省委农工办,2005/03-2005/10;
28、农村公共投资影响农民增收的实证与量化研究,周应恒(主持)、王图展 杨美丽,江苏省哲学社会科学研究,2004/09-2005/09;
29、信息可追踪体系在保障南京市食品质量安全中的应用研究,周应恒(主持)、苏群、胡浩、邹林刚、彭晓佳,南京市软科学,2004/07-2005/06;
30、中澳农业谈判对我国农产品贸易产生的影响研究,周应恒(主持)、钟甫宁 周曙东 朱晶,商务部,2004-2005;
31、中澳农业谈判对我国农产品生产和就业的影响研究,周应恒(主持)、钟甫宁 朱晶 周曙东,商务部,2004-2005;
32、食品质量安全的风险控制及管理体系构建研究,周应恒(主持)、应瑞瑶 胡浩 ,教育部博士点基金,2003/01-2004/12;
33、中国环境农业政策与粮食安全、财政负担能力研究,沈金虎(主持)、周应恒,日本文部科学省,2002/04-2004/03;
34、江苏省丘陵山区农业综合开发效果评价,周应恒(主持)、,江苏省农业资源开发局,2003-2004;
35、我国食品质量安全的风险控制与管理体系研究,周应恒(主持)、应瑞瑶 胡浩,农业部软科学,2003/04-2003/12;
36、农产品流通结构变化与食品质量安全管理,周应恒(主持)、,博士后基金,2001-2003;
37、转换期的中国农产品生产消费行为的综合分析研究,沈金虎(主持)、周应恒,日本文省部,2000/04-2002/03;
38、中国农业关联产业结构与农业产业化战略研究,周应恒(主持)、,教育部,1999/10-2001/09;
39、中国粮食的自给潜力与长期供求的综合研究,严善平(主持)、周应恒,日本文省部,2000/04-2001/03;
40、中国粮食市场政策研究,钟甫宁(主持)、周应恒,国际合作,1999-2001;