受中共中央台办之邀，周应恒教授作为学界代表参加了10月17日至18日在海南博鳌举行的“两岸农业合作论坛”。

中共中央政治局常委、全国政协主席贾庆林和中国国民党荣誉主席连战出席了论坛开幕式，并分别发表了演讲。中共中央政治局委员、国务院副总理吴仪出席了开幕式。本届论坛由中共中央台办海研中心与中国国民党国政研究基金会共同主办；亲民党荣誉副主席钟荣吉、新党主席郁慕明等也出席了开幕式。

开幕式以后，论坛以“加强两岸农业合作，实现两岸农业互利双赢”为主题，就“加入ＷＴＯ后两岸农业合作面临之机遇与挑战”、“当前两岸农业合作模式之探讨”、“两岸农业合作发展之问题与对策”三项议题进行了分组研讨。周应恒教授在小组讨论会上做了10分钟主题发言，提出了海峡两岸在农业链条上分工合作实现“双赢”以及正确认识农业技术溢出效应等两个鲜明观点，在论坛上引起了较大反响。